Η Ιατρική Σχολή του Πανεπιστημίου της Σόφιας ξεκίνησε την ακαδημαϊκή της ζωή με βάση τον νόμο που ψηφίστηκε από τη 17η Εθνοσυνέλευση στις 10 Νοεμβρίου 1917.
Η πρώτη διάλεξη στη σχολή στην ιατρική έλαβε χώρα στις 10 Απριλίου 1918. Ο τότε Υπουργός Παιδείας εγκαινίασε το Ιατρικό Πανεπιστήμιο παρουσία του Ανώτατου Ιατρικού Συμβουλίου που αποτελείτο από τον καθηγητή G. Shishkov z, ο οποίος έκανε την πρώτη διάλεξη για τη ζωολογία, και η δεύτερη είναι από τον Αλ. Hristov, καθηγητής φυσικής.
Η τροποποίηση του Νόμου για την Τριτοβάθμια Εκπαίδευση που εγκρίθηκε το 1946 αύξησε τον αριθμό των τμημάτων από 12 σε 31. Το 1950, σύμφωνα με το Διάταγμα Νο 246 του Προεδρείου της Εθνοσυνέλευσης, ιδρύθηκε Ιατρική Ακαδημία. Έτσι, η Ιατρική Σχολή γίνεται ανεξάρτητο ίδρυμα του Πανεπιστημίου της Σόφιας. Διευθυντής του ορίστηκε ο καθηγητής M. Markov. Την ίδια χρονιά ιδρύθηκε το Ινστιτούτο Βελτίωσης και Εξειδίκευσης Ιατρών.
Το 1954, η Ιατρική Ακαδημία μετονομάστηκε σε Ανώτατο Ιατρικό Ινστιτούτο - τη μεγαλύτερη ιατρική σχολή στη Βουλγαρία.
Για πολλά χρόνια μετά την απελευθέρωση της Βουλγαρίας, οι φαρμακοποιοί φοιτούσαν σε κορυφαία ξένα πανεπιστήμια. Μετά το 1880 στη χώρα εκπαιδεύονταν μόνο οι βοηθοί του φαρμακοποιού με κανονισμό που εγκρίθηκε από το Ανώτατο Ιατρικό Συμβούλιο.
Ως εκ τούτου, η δημιουργία του Φαρμακευτικού Τμήματος στη Φυσικομαθηματική Σχολή του Πανεπιστημίου της Σόφιας το 1942, μετά από πρόταση του καθηγητή Αλεξίεφ, ήταν το πρώτο κομβικό σημείο της επιστημονικής φαρμακευτικής στη Βουλγαρία. Η μεταφορά αυτού του τμήματος το 1951 στη νεοσύστατη Ιατρική Ακαδημία σηματοδοτεί την έναρξη της σημερινής Φαρμακευτικής Σχολής του Ιατρικού Πανεπιστημίου της Σόφιας με πρώτο κοσμήτορα τον καθηγητή Dimitar Dalev.
Το ξεκίνημα του οδοντιατρικού επαγγέλματος στη Βουλγαρία έκανε ο γιατρός Friedrich Karl Flamich, γεννημένος στην Πράγα. Το 1869, ήταν ο πρώτος πτυχιούχος οδοντίατρος που πήρε το δικαίωμα να ασκήσει το επάγγελμα στο Ρούσε και αργότερα πραγματοποίησε συνέδριο στη Σόφια βάσει του τότε νόμου για τη δημόσια υγεία. Το όνομά του φέρει το μουσείο της οδοντιατρικής σχολής, όπου σώζονται κάποια μουσειακά εκθέματα.
Η πρώτη Γναθοπροσωπική Χειρουργική Κλινική ιδρύθηκε πριν από 77 χρόνια τη δεκαετία του 1940. Κατά τη διάρκεια των ετών από την ίδρυσή της μέχρι σήμερα, από την Οδοντιατρική Σχολή έχουν αποφοιτήσει πάνω από 10.300 Βούλγαροι και περίπου 900 ξένοι από 85 χώρες από την Ευρώπη, την Αμερική, την Ασία και την Αφρική. Από την 01 Ιανουαρίου 2007, βάσει της Ευρωπαϊκής Οδηγίας 16 για τα νομοθετικά κατοχυρωμένα επαγγέλματα, η ειδικότητα «Στοματολογία» μετονομάστηκε επιτυχώς σε «Οδοντιατρική» και «στοματολόγος» σε «οδοντίατρος».
Η ανάγκη ενσωμάτωσης των προσπαθειών για τη δημόσια υγεία οδήγησε στη μετατροπή της Σχολής Αδελφότητας σε Σχολή Δημόσιας Υγείας το 2001. Η εφαρμογή της υποστηρίχθηκε από το Σύμφωνο Σταθερότητας και σε συνεργασία με κορυφαία ιδρύματα στην Ευρωπαϊκή Ένωση και τον Παγκόσμιο Οργανισμό Υγείας (ΠΟΥ ). Με αυτόν τον τρόπο δημιουργήθηκε μια τέταρτη σχολή πλήρους σχολής με ευρωπαϊκό ήχο στη δομή του Ιατρικού Πανεπιστημίου, η οποία συμπληρώνει την πανεπιστημιακή διδασκαλία στον τομέα των ανθρωπιστικών και κοινωνικών επιστημών. Οι ακαδημαϊκές και ερευνητικές του δραστηριότητες διεξάγονται από ακαδημαϊκούς υψηλής ειδίκευσης με εμπειρία στον τομέα της πολιτικής υγείας και της διαχείρισης υγείας.
Το Ιατρικό Πανεπιστήμιο εντάχθηκε στο πρόγραμμα SOCRATES/ERASMUS της Ευρωπαϊκής Κοινότητας το 1999. Πρόκειται για ένα πρόγραμμα επαφών με πανεπιστήμια του εξωτερικού με σκοπό την αύξηση του ποσοστού των φοιτητών που πραγματοποιούν μια περίοδο σπουδών σε άλλη ευρωπαϊκή χώρα.
ECTS – ΕΥΡΩΠΑΪΚΟ ΣΥΣΤΗΜΑ ΜΕΤΑΦΟΡΑΣ ΠΙΣΤΩΤΙΚΩΝ ΜΟΝΑΔΩΝ. Το ECTS είναι ένα αποκεντρωμένο σύστημα που βασίζεται στην αρχή της αμοιβαίας εμπιστοσύνης μεταξύ των συμμετεχόντων εκπαιδευτικών ιδρυμάτων. Παρέχει έναν τρόπο μέτρησης και σύγκρισης των μαθησιακών επιτευγμάτων των μαθητών χρησιμοποιώντας κοινώς κατανοητές μετρήσεις, μονάδες και βαθμούς και τη μεταφορά τους από το ένα ίδρυμα στο άλλο, διευρύνοντας έτσι τις επιλογές που είναι διαθέσιμες στους μαθητές. Το σύστημα αυτό εισήχθη στο Ιατρικό Πανεπιστήμιο – Σόφια το ακαδημαϊκό έτος 2000/2001.
Το Ιατρικό Πανεπιστήμιο – Σόφια είναι ένα από τα πιο εξέχοντα και τεράστια υγειονομικά, εκπαιδευτικά και επιστημονικά κέντρα της βουλγαρικής ιατρικής επιστήμης. Οι παραδόσεις από πολύ παλιά το οδηγούν στη θέση που του αξίζει – ανάμεσα στα πιο σεβαστά ευρωπαϊκά πανεπιστήμια.
Δίδακτρα για προπτυχιακές σπουδές στην Ιατρική και την Οδοντιατρική 8000 ευρώ και 6000 ευρώ για τη φαρμακευτική.
